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病理解剖顯示小腸活檢僅顯示輕微炎癥。絨毛細胞有變形的微絨毛或沒有微絨毛的大假足細胞質(zhì)突起，從頂端細胞表面延伸到腸腔。隱窩細胞也有延伸到隱窩腔的假心影突起。
上皮細胞包括線粒體腫脹和嵴消失、高爾基囊泡增加、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)擴張和囊泡形成。死亡患者的主要病理變化為嚴重脫水：早期皮膚干燥發(fā)紺，皮下組織和肌肉干燥。內(nèi)臟漿膜暗沉，腸內(nèi)充滿米泔水樣液體，膽囊內(nèi)充滿粘稠膽汁。
心、肝、脾等器官減少。腎小球和間質(zhì)毛細血管擴張，腎小管腫脹渾濁，變性壞死。其他器官也有出血、變性等改變。
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